国旗护卫队设立队长、指导员各一名。为强化责任意识，提高工作效率，规范管理制度，根据工作需要，特明确护卫队干部职责如下。
一、国旗护卫队队长职责
1.制定训练方案，包括：训练计划、训练进度、考核方法、工作日程安排。
2.掌握每周训练进度，研究解决训练中出现的问题。
3.根据天气和情况变化提出和调整训练计划。
4.研究和改进训练方法，总结交流工作经验，期末进行护卫队年终总结，评选优秀护卫队队员。
5.掌握训练出勤情况，及时关注未参加训练队员的情况。
6.严格坚持请销假制度。
7.负责联系当月升旗主办方院系，规范升旗流程。
8.提高队员责任意识，确保升旗质量。
9.保障升旗所需器材。
10.做好护卫队的服装管理工作，定期检查服装整洁度和完整度。
11.完成领导交给的其他工作任务。
二、国旗护卫队指导员职责
1.及时了解护卫队全体队员的思想状况，关心队员的学习训练生活，主动帮助他们解决实际困难，做到晓之以理，动之以情，增进团结。
2.、做好队员出勤率统计和每月训练补助的发放工作。
3.加强国旗护卫队的内外宣传工作。
4.做好思想政治工作。
5.利用业余时间，组织护卫队成员参加校内外有意义的活动，丰富护卫队的生活。
6.完成领导交给的其他工作任务。